MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 383

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334880
2	NC_008499	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	116334880
3	NC_008499	AGCA	2	8	631	638	50 %	0 %	25 %	25 %	116334880
4	NC_008499	TCA	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334880
5	NC_008499	CTTT	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	116334880
6	NC_008499	GCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
7	NC_008499	GTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
8	NC_008499	AAG	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
9	NC_008499	GC	3	6	1198	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	116334881
10	NC_008499	AAAG	2	8	1290	1297	75 %	0 %	25 %	0 %	116334881
11	NC_008499	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
12	NC_008499	CGCATG	2	12	1463	1474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116334881
13	NC_008499	CTAA	2	8	1567	1574	50 %	25 %	0 %	25 %	116334881
14	NC_008499	A	6	6	1628	1633	100 %	0 %	0 %	0 %	116334881
15	NC_008499	GGC	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
16	NC_008499	CAA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
17	NC_008499	A	7	7	1685	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	116334881
18	NC_008499	CAA	2	6	1801	1806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
19	NC_008499	AAG	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334881
20	NC_008499	ATA	2	6	1841	1846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334881
21	NC_008499	CAA	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
22	NC_008499	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
23	NC_008499	CTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
24	NC_008499	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334881
25	NC_008499	GTG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334881
26	NC_008499	A	6	6	2131	2136	100 %	0 %	0 %	0 %	116334881
27	NC_008499	GAAC	2	8	2158	2165	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
28	NC_008499	CGG	2	6	2179	2184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334881
29	NC_008499	TTA	2	6	2269	2274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334881
30	NC_008499	CAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
31	NC_008499	ACA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
32	NC_008499	GTC	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334881
33	NC_008499	ATG	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
34	NC_008499	CAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
35	NC_008499	ACA	2	6	2871	2876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334881
36	NC_008499	AAGC	2	8	2899	2906	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
37	NC_008499	ATTA	2	8	2929	2936	50 %	50 %	0 %	0 %	116334881
38	NC_008499	TGA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334881
39	NC_008499	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334881
40	NC_008499	A	6	6	3073	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	116334881
41	NC_008499	TGTAA	2	10	3128	3137	40 %	40 %	20 %	0 %	116334881
42	NC_008499	TAAT	2	8	6213	6220	50 %	50 %	0 %	0 %	116334882
43	NC_008499	T	7	7	6220	6226	0 %	100 %	0 %	0 %	116334882
44	NC_008499	TCT	2	6	6243	6248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
45	NC_008499	TCAA	2	8	6330	6337	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
46	NC_008499	TCT	2	6	6417	6422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
47	NC_008499	ACC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334882
48	NC_008499	TCT	2	6	6432	6437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
49	NC_008499	T	6	6	6442	6447	0 %	100 %	0 %	0 %	116334882
50	NC_008499	ATA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
51	NC_008499	AAT	2	6	6496	6501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
52	NC_008499	T	6	6	6579	6584	0 %	100 %	0 %	0 %	116334882
53	NC_008499	CAAT	2	8	6600	6607	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
54	NC_008499	AT	3	6	6606	6611	50 %	50 %	0 %	0 %	116334882
55	NC_008499	TCT	2	6	6636	6641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
56	NC_008499	TCT	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
57	NC_008499	TAT	2	6	6667	6672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
58	NC_008499	AAT	2	6	6706	6711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
59	NC_008499	AG	3	6	6736	6741	50 %	0 %	50 %	0 %	116334882
60	NC_008499	TCT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334882
61	NC_008499	A	6	6	6767	6772	100 %	0 %	0 %	0 %	116334882
62	NC_008499	ATTT	2	8	6817	6824	25 %	75 %	0 %	0 %	116334882
63	NC_008499	TTA	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
64	NC_008499	T	7	7	6859	6865	0 %	100 %	0 %	0 %	116334882
65	NC_008499	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334882
66	NC_008499	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334882
67	NC_008499	TG	3	6	6894	6899	0 %	50 %	50 %	0 %	116334882
68	NC_008499	T	6	6	6908	6913	0 %	100 %	0 %	0 %	116334882
69	NC_008499	TTCA	2	8	6920	6927	25 %	50 %	0 %	25 %	116334882
70	NC_008499	TAA	2	6	6989	6994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334882
71	NC_008499	AT	3	6	7017	7022	50 %	50 %	0 %	0 %	116334882
72	NC_008499	CAAA	2	8	7057	7064	75 %	0 %	0 %	25 %	116334882
73	NC_008499	ATC	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334882
74	NC_008499	CTG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334882
75	NC_008499	AAT	2	6	7709	7714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334883
76	NC_008499	ATC	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
77	NC_008499	TCA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334883
78	NC_008499	ATTT	2	8	7780	7787	25 %	75 %	0 %	0 %	116334883
79	NC_008499	ATG	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334883
80	NC_008499	TTG	2	6	7822	7827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334883
81	NC_008499	T	6	6	7866	7871	0 %	100 %	0 %	0 %	116334883
82	NC_008499	GC	3	6	8174	8179	0 %	0 %	50 %	50 %	116334884
83	NC_008499	ATT	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
84	NC_008499	A	6	6	8289	8294	100 %	0 %	0 %	0 %	116334884
85	NC_008499	TGA	2	6	8469	8474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
86	NC_008499	ATT	2	6	8483	8488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334884
87	NC_008499	CAA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334884
88	NC_008499	AGC	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
89	NC_008499	GAT	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
90	NC_008499	GAC	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334884
91	NC_008499	GAAA	2	8	8715	8722	75 %	0 %	25 %	0 %	116334884
92	NC_008499	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334884
93	NC_008499	TTG	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
94	NC_008499	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334885
95	NC_008499	A	6	6	9262	9267	100 %	0 %	0 %	0 %	116334885
96	NC_008499	GAT	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
97	NC_008499	TGG	3	9	9558	9566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
98	NC_008499	GAT	2	6	9621	9626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
99	NC_008499	TGA	2	6	9716	9721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
100	NC_008499	TTG	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
101	NC_008499	CGC	2	6	9830	9835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334885
102	NC_008499	GTT	2	6	9857	9862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334885
103	NC_008499	TGG	2	6	9876	9881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
104	NC_008499	CTG	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334885
105	NC_008499	GCAA	2	8	10098	10105	50 %	0 %	25 %	25 %	116334885
106	NC_008499	CGA	2	6	10144	10149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334885
107	NC_008499	AGTT	2	8	10187	10194	25 %	50 %	25 %	0 %	116334885
108	NC_008499	TGA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
109	NC_008499	TTGC	2	8	10243	10250	0 %	50 %	25 %	25 %	116334885
110	NC_008499	GAT	2	6	10267	10272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334885
111	NC_008499	TGG	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334885
112	NC_008499	GA	3	6	10289	10294	50 %	0 %	50 %	0 %	116334885
113	NC_008499	TTG	3	9	13473	13481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334886
114	NC_008499	CGG	2	6	13492	13497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116334886
115	NC_008499	ATG	2	6	13629	13634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334886
116	NC_008499	AAAT	2	8	13704	13711	75 %	25 %	0 %	0 %	116334886
117	NC_008499	A	6	6	13837	13842	100 %	0 %	0 %	0 %	116334886
118	NC_008499	GCT	2	6	13952	13957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334886
119	NC_008499	CTG	2	6	14133	14138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334886
120	NC_008499	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	116334886
121	NC_008499	AGT	2	6	14434	14439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334886
122	NC_008499	TCA	2	6	14444	14449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334886
123	NC_008499	TCA	2	6	14626	14631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334886
124	NC_008499	GGT	2	6	14639	14644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334886
125	NC_008499	CAA	2	6	14702	14707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334886
126	NC_008499	CCAG	2	8	14749	14756	25 %	0 %	25 %	50 %	116334886
127	NC_008499	AGC	2	6	14788	14793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334886
128	NC_008499	TGA	2	6	15628	15633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334887
129	NC_008499	ATTA	2	8	15654	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	116334887
130	NC_008499	TGC	2	6	15669	15674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334887
131	NC_008499	TCA	2	6	15682	15687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334887
132	NC_008499	GAA	2	6	15720	15725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334887
133	NC_008499	ATGG	2	8	15779	15786	25 %	25 %	50 %	0 %	116334887
134	NC_008499	GTT	2	6	16066	16071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334887
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.